Musō Shinden Ryū -tyylin iaidō on yksi suurimpia iaidosuuntauksista sekä Japanissa että maailmalla. Se pohjautuu Japanin itäosissa 1500-1600 luvun taitteessa eläneen Hayashizaki Jinsuke Minamoto no Shigenobu -nimisen samurain kehittämään miekanvetotaitoon eli iaijutsuun. Lukuisat miekanvetokoulukunnat pitävät Hayashizakia kantaisänään. Hänen koulukuntansa nimi oli alun perin Shinmei Musō Ryū, ja taidosta käytettiin tuolloin nimitystä battōjutsu. Opettajansa kuoltua hänen oppilaansa nimesivät tyylin Shin Musō Hayashizaki Ryū’ksi.
Koulukunnan seitsemäs päämies, Hasegawa Chikara-no-suke Eishin lisäsi koulukunnan ohjelmaan harjoituksia, joissa tekniikat alkavat tatehizasta (“puolipolviasento”), ja hänen kerrotaan muutenkin uudistaneen tyylisuuntaa. Tyylisuunnan nimikin vaihtui Hasegawa Eishin Ryū’ksi.
Tyyli kotiutui lopullisesti Tosan (nyk. Kōchi) maakuntaan, kun Hayashi
Rokudayu Morimasa’sta (1661-1732) tuli yhdeksäs päämies ja Eishin ryūsta tuli osa maakunnan virallista harjoittelua Tosan samuraille. Tyyli tuli tunnetuksi nimellä Tosa Eishin Ryū.
Nykyisen muodon Musō Shinden Ryū’lle antoi mestarimiekkailija Nakayama Hakudō. Hän oli yksi merkittävimmistä henkilöistä japanilaisen budōn maailmassa 1900-luvun alkupuoliskolla. Hänellä oli hanshin (korkein opettajan arvo) arvot kendōssa, iaidōssa ja jōdōssa.
Nakayama Hiromichi Hakudō syntyi v. 1872 Ishikawan maakunnassa Kanazawan kaupungissa. Vuonna 1889 hän tuli Tokioon ja aloitti Shindō Munen Ryūn harjoittelun Negishi Shingorōn Yūshinkan dōjōlla. Hän oli siis alun perin Shindō Munen Ryū -kenjutsun mestari, mutta ymmärtääkseen japanilaisen miekan todellisen luonteen hän halusi oppia myös kuuluisan Tosan Iai’n.
Sitkeiden yritysten jälkeen hän onnistui pääsemään lopulta useammankin Tosan alueen iai-mestarin oppilaaksi, vaikka Tosan opettajat eivät aluksi
halunneetkaan opettaa taitoaan ulkopuoliselle. Iai’ta harjoitteli tuohon aikaan hyvin harva henkilö, ja opetus oli lähinnä pienten ryhmien ylläpitämää henkilökohtaista opetusta. Hakudō tutustutti myös asiasta kiinnostuneita kendō-oppilaitaan iaidōn salaisuuksiin. Hakudōn vaikutuksesta iai-harjoittelu tuli vähitellen yhä suositummaksi, ja sitä alettiin opettaa laajemmaltikin. Hakudō käytti opettamastaan iai’sta mm. nimitystä Hayashizaki Musō Shinden Ryū, Musō Shinden Ryū battōjutsu tai yksinkertaisesti opetettavasta sarjasta riippuen Ōmori Ryū ja Hasegawa Eishin Ryū. Hän otti myös käyttöön iaidō-termin, jolla hän viittasi harjoittelun henkiseen painotukseen.
Hakudōn kuoleman jälkeen (1958) hänen oppilaansa nimesivät koulun Musō Shinden Ryū’ksi.